home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Arsenal Files 6 / The Arsenal Files 6 (Arsenal Computer).ISO / health / med9604b.zip / M9640606.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-03-04  |  2KB  |  31 lines
  1.        Document 0606
  2.  DOCN  M9640606
  3.  TI    A mean field model of ligand-protein interactions: implications for the
  4.        structural assessment of human immunodeficiency virus type 1 protease
  5.        complexes and receptor-specific binding.
  6.  DT    9604
  7.  AU    Verkhivker GM; Rejto PA; Agouron Pharmaceuticals Inc., San Diego, CA
  8.        92121, USA.
  9.  SO    Proc Natl Acad Sci U S A. 1996 Jan 9;93(1):60-4. Unique Identifier :
  10.        AIDSLINE MED/96133877
  11.  AB    We propose a general mean field model of ligand-protein interactions to
  12.        determine the thermodynamic equilibrium of a system at finite
  13.        temperature. The method is employed in structural assessments of two
  14.        human immuno-deficiency virus type 1 protease complexes where the gross
  15.        effects of protein flexibility are incorporated by utilizing a data base
  16.        of crystal structures. Analysis of the energy spectra for these
  17.        complexes has revealed that structural and thermo-dynamic aspects of
  18.        molecular recognition can be rationalized on the basis of the extent of
  19.        frustration in the binding energy landscape. In particular, the
  20.        relationship between receptor-specific binding of these ligands to human
  21.        immunodeficiency virus type 1 protease and a minimal frustration
  22.        principle is analyzed.
  23.  DE    Aspartic Proteinases/CHEMISTRY  HIV Protease/*CHEMISTRY  HIV Protease
  24.        Inhibitors/*CHEMISTRY  HIV-1/*ENZYMOLOGY  Ligands
  25.        Oligopeptides/*CHEMISTRY  *Protein Binding  Protein Conformation
  26.        Temperature  Thermodynamics  JOURNAL ARTICLE
  27.  
  28.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  29.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  30.  
  31.